一般来说，拘留期限内未能查清犯罪事实的，依法办理取保候审或者监视居住手续后，继续侦查。如果撤销案件的，释放被拘留的人，发给释放证明。对于需要逮捕的，在拘留期限内，依法办理提请批准逮捕手续。对于应当追究刑事责任，但不需要逮捕的，依法办理取保候审或者监视居住手续。
根据刑事诉讼法的规定
1、对于被刑事拘留的人，公安机关应当在拘留后的24小时内进行讯问。发现不应当被拘留的，签发《释放通知书》，看守所凭《释放通知书》发给被拘留人《释放证明书》，将其立即释放。
2、对被拘留的犯罪嫌疑人审查后，根据案件情况经县级以上公安机关负责人批准，分别作出如下处理：
(1)需要逮捕的，在拘留期限内，依法办理提请批准逮捕手续;
(2)应当追究刑事责任，但不需要逮捕的，依法办理或者手续后，直接向人民检察院移送起诉;
(3)拘留期限内未能查清犯罪事实的，依法办理取保候审或者监视居住手续后，继续侦查;
(4)撤销案件的，释放被拘留人，发给释放证明。
被刑事拘留后，如果不能及时协助公安机关查明案件情况，解除犯罪嫌疑，就有可能被公安机关提请逮捕，案件正式进行立案侦查程序。拘留期限到期后，如果没有被提请逮捕，也没有被释放需要及时提出申诉、控告。
附《刑事诉讼法》
第八十六条 公安机关对被拘留的人，应当在拘留后的二十四小时以内进行讯问。在发现不应当拘留的时候，必须立即释放，发给释放证明。
第八十七条 公安机关要求逮捕犯罪嫌疑人的时候，应当写出提请批准逮捕书，连同案卷材料、证据，一并移送同级人民检察院审查批准。必要的时候，人民检察院可以派人参加公安机关对于重大案件的讨论。