1.认定标准不同
对于判定一家企业是小规模还是一般纳税人，最直接的标准就是年销售额（连续12个月），以5百万为基准线划分，小规模纳税人的年销售额低于5百万，大于5百万即会成为一般纳税人。
2.纳税税率不同
一般纳税人企业的增值税缴纳税率是6%、9%、13%，小规模纳税人是的3%。
纳税税率对企业来说影响重大，因为其直接决定了企业需缴的增值税金额。
3.申报时间不同
小规模纳税人和一般纳税人每个月、季所申报的税种也不同。
小规模纳税人每月申报个人所得税，每季度申报增值税、附加税和企业所得税。
一般纳税人每月申报个人所得税、增值税和附加税，每季度申报企业所得税。
4.进项抵扣不同
小规模纳税人取得的不管是专票还是普票，都只能抵扣企业所得税，不得抵扣增值税。
一般纳税人取得的专票可抵扣增值税，取得的普票可抵扣企业所得税。
5.税收优惠不同
税收优惠主要适用于小规模企业，一般纳税人很少有税收优惠政策。
小规模纳税人开具普票，年度在五百万免收增值税。小规模开具专票，
正常缴纳增值税，附加税减半征收。
小规模纳税人的企业所得税优惠：
所得税应税额≤100万，税率为2.5%；
所得税应税额在100万到300万之间，税率为5%；
所得税应税额大于300万，税率为25%。