合同补充协议与主合同的效力（一）主合同与补充协议
主合同与补充协议一般不会同时产生，会有时间差，主合同成立时间在前，补充合同成立时间在后，这是补充合同产生的时间规律。
补充协议是主合同的从属合同，补充合同依附于主合同而成立，没有主合同，就不会产生补充合同，这是主合同与补充合同的基本关系。
主合同因为有了补充协议，所以使得主合同原意更准确、更完善、更具有可操作性。
补充协议的编号往往是以主合同为依托而表达的，如__号合同补1、补2，这是强调二者主从关系的实质体现。因为有了补充协议这种特殊形式，能够保证双方履约顺利，合同纠纷减少。
（二）补充协议的效力
当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行。时间在后的约定，实际上是对主合同的原约定的重新修订，该新约定是补充合同的精要和实质。如果仍以主合同的原条款为准执行，那就失去了补充合同存在的意义。
（三）补充协议与合同变更
补充协议对主合同补充太多的新约定，则该补充合同就难以称之补充协议与主合同的效力为补充合同了。补充协议对主合同修改得太多，超过了适当的量，或补充协议对主合同的实质要件进行了较大的补充修改。比如对价格条款，技术标准，履约期限等约定进行了不利于其中一方的修改，这也不能称之为补充协议。这些补充和修改已经符合合同变更的要求，应该称之为合同变更。
附：补充协议合同范本
借款合同补充协议书范本2
甲方： 身份证号：
乙方： 身份证号：
甲乙双方经协商一致，对双方于20xx年10月26日签订的《借款合同》作出如下补充：
一、借款期限。原合同约定“借款期限：20xx年11月1号至20xx年11月1号止”，现甲乙双方自愿协商一致，将还款期限提前一年，即甲方于20xx年11月1日前返还其借甲方的人民币贰拾万圆整（小写200000.00）。
二、若因甲方的过错而导致的仲裁、诉讼等产生的一切费用（包括但不限于律师费、诉讼费、仲裁费用、差旅费等开支）均由甲方承担。
三、甲乙双方未做变更或补充的均以原借口合同为准。
四、本协议一式两份，甲、乙双方签字即生效。
甲方：乙方：
合同签订日期：
合同签订地点：